MPA公共管理硕士，主要的学习内容为行政组织和管理的系统学习，包括角色介绍、发展和公共管理规则、公共政策管理、行政与法律的关系、公共预算过程和财务管理、行政法、公共人事管理、职业道德以及研究方法这些知识。

MPP公共政策硕士，主要是研究公共政策问题与决策程序的系统分析，主要学习公共政策制定中的经济与政治影响、政策问题的围观经济分析、资源配置以及决策模型、成本/效益分析、统计方法以及特定公共政策主题应用等知识。

MPA与MPP相比，更偏向于管理与实践技巧，MPP偏向政策研究与评估。而且培养的学生也是不相同的，MPA主要是培养企业管理者，MPP培养的是政策分析院。MPA与MPP项目是相互融合、相互补充的，都是为了促进人类公众利益的发展，二者密不可分。